異なるドキュメントタイプのドキュメントを1つの書類作成用テンプレートで出力することはできますか？

はい、できます。書類作成用テンプレートでは、テンプレート変数を{{ドキュメントタイプ名.解析項目名}}という形式で記述するため、1つのテンプレートの中に異なる複数のドキュメントタイプの解析項目を混在させて指定できます。

実際に、複数のドキュメントタイプの解析結果を組み合わせて1つの出力をしたい場合は、書類作成機能の利用が推奨されるケースのひとつです。例えば、見積書と発注書など異なるドキュメントタイプの情報を1つの帳票にまとめて出力するといった使い方ができます。

＊この機能は、ある程度プロジェクト単位でドキュメントを整理していることが前提となっています。ドキュメントタイプ自体には同一タイプのドキュメントしか属することができませんが、プロジェクトには異なるドキュメントタイプのドキュメントをまとめて所属させることができます。書類作成を実行する際も、はじめに対象のプロジェクトを1つ以上選択し、そのプロジェクトに属するドキュメントの中からテンプレートに適用するドキュメントを選ぶという流れになるため、異なるドキュメントタイプを組み合わせて出力したい場合は、あらかじめそれらのドキュメントを同じプロジェクトに整理しておく必要があります。